El programa de Historia está integrado a la Facultad de Ciencias Humanas y Sociales de la Universidad del Cauca, cuya misión y visión se expresa en el PEI, Acuerdo 096 del 22 de diciembre de 1998, el cual establece la prioridad de formar personas con integridad ética e idoneidad profesional, demócratas comprometidos con la ciudad y en armonía con el entorno.

La Universidad del Cauca genera y socializa la ciencia, la técnica, la tecnología, el arte y la cultura en la docencia, la investigación y la proyección social. En este sentido, la misión del programa de Historia es la formación de investigadores con competencias para analizar la sociedad, la política, las mentalidades, la economía, y en relación con la microhistoria y la historia regional, conforme a una estructura interdisciplinaria que busca interactuar con los demás conjuntos sociales del departamento y del país.

Asumiendo de esta forma, el compromiso ético para construir un tejido social por medio de la investigación, la lectura, la escritura y la difusión de sus contenidos a través de las actuales tecnologías de la comunicación. Esta misión se evidencia en el diseño curricular del programa y la vinculación de sus egresados en diversos campos laborales en los contextos regional y local.